Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kndc1Q0KK55 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms