Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F13bQ07968 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13bQ07968 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13bQ07968 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13bQ07968 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F13bQ07968 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
F13bQ07968 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F13bQ07968 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F13bQ07968 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms