Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a2Q07643 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a2Q07643 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms