Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp2Q06649 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp2Q06649 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms