Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cxcr5Q04683 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms