Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smpd1Q04519 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms