Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl7Q03366 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms