Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Runx1Q03347 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms