Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkczQ02956 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms