Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjb5Q02739 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms