Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GscQ02591 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GscQ02591 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GscQ02591 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GscQ02591 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GscQ02591 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GscQ02591 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GscQ02591 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GscQ02591 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GscQ02591 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GscQ02591 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GscQ02591 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GscQ02591 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GscQ02591 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms