Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms