Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms