Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds1P98191 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cds1P98191 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cds1P98191 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms