Protein–RNA interactions for Protein: P98154

Dgcr2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr2P98154 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dgcr2P98154 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dgcr2P98154 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms