Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VegfdP97946 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VegfdP97946 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms