Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlkP97793 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AlkP97793 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AlkP97793 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AlkP97793 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AlkP97793 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AlkP97793 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AlkP97793 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AlkP97793 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AlkP97793 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlkP97793 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlkP97793 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlkP97793 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlkP97793 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlkP97793 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlkP97793 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlkP97793 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlkP97793 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AlkP97793 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlkP97793 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlkP97793 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlkP97793 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlkP97793 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlkP97793 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlkP97793 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlkP97793 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlkP97793 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlkP97793 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AlkP97793 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlkP97793 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlkP97793 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlkP97793 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlkP97793 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlkP97793 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlkP97793 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlkP97793 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AlkP97793 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AlkP97793 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms