Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhodP97348 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhodP97348 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhodP97348 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhodP97348 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RhodP97348 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RhodP97348 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhodP97348 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms