Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gabpb2P81069 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gabpb2P81069 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms