Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Q6P79568 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Q6P79568 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms