Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf11P70378 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf11P70378 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms