Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casp4P70343 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms