Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad1P70340 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms