Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux2P70298 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux2P70298 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux2P70298 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux2P70298 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms