Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NficP70255 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NficP70255 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NficP70255 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NficP70255 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NficP70255 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NficP70255 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NficP70255 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NficP70255 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NficP70255 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NficP70255 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NficP70255 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NficP70255 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NficP70255 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NficP70255 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NficP70255 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NficP70255 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NficP70255 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms