Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf6P70196 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf6P70196 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms