Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps3P62908 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps3P62908 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms