Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab3cP62823 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab3cP62823 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab3cP62823 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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