Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms