Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem258P61166 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem258P61166 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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