Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3eP60229 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms