Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtnsP57757 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtnsP57757 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtnsP57757 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms