Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms