Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd3P55096 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms