Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GemP55041 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GemP55041 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GemP55041 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GemP55041 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GemP55041 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GemP55041 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GemP55041 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GemP55041 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GemP55041 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 293.6 ms