Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms