Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms