Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fdft1P53798 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms