Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms