Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgd1P52734 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms