Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1cP52432 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms