Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec1P51908 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms