Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccr4P51680 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms