Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SftpdP50404 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms