Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxc13P50207 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms