Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Tmod1P49813 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Tmod1P49813 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Tmod1P49813 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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