Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CitP49025 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CitP49025 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CitP49025 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CitP49025 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CitP49025 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CitP49025 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CitP49025 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CitP49025 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CitP49025 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CitP49025 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CitP49025 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CitP49025 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CitP49025 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CitP49025 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CitP49025 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CitP49025 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CitP49025 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CitP49025 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CitP49025 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CitP49025 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.6 ms