Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TgfaP48030 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms