Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tlx1P43345 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms