Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtgfrP43117 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms